小規模營利事業登記的負責人，給付房東租金時，應每次給付時依規扣繳率10%扣取稅款，並下個月10日前將扣取稅款向國庫繳清，若每次應扣繳稅額不超過2,000元者，則免予扣繳，而不論是應扣繳或免予扣繳，都須每年1月底前將上年度內扣繳的稅款開具扣（免）繳憑單申報。

小規模營業人例如早餐店、麵食館、飲料店、自助餐等營業人，因不諳稅法的扣繳規定，於給付員工薪資或給付房東租金時，往往未依規定扣取稅款及申報扣免繳憑單而遭補稅送罰。

小規模營利事業所登記的負責人，如於給付房東租金時，未依規定扣繳所得稅款，國稅局會限期責令補繳應扣未扣，或短扣的稅款及補報扣繳憑單。

按應扣未扣或短扣的稅額處一倍以下的罰鍰；而若是其未於限期內補繳應扣未扣或短扣的稅款，或不按時補報扣繳憑單者，將會按應扣未扣，或短扣的稅額處三倍以下罰鍰。