財團法人所得稅課稅改革，在這次「全民稅改」可說是最後關頭加上的「意外一章」。今後財團法人所得是否免稅，回歸財政部所訂的公益機關、團體免稅適用標準，外界將此一變革視為「長庚條款」。

KPMG安侯建業聯合會計師事務所稅務部營運長張芷分析，財團法人課稅新制一旦上路，將衝擊每年股票孳息上億的大型財團法人。家族企業也會擔憂醫療財團法人「大權旁落」，影響對上市集團公司的控制力。

經濟日報提供

這次稅改刪除了「所得稅法」第42條，也就是刪除「財團法人投資營利事業獲配股利不計入所得額課稅」規定。

財政部官員解釋，未來財團法人能否免稅回歸「教育文化公益慈善機關或團體免納所得稅適用標準」。

目前財政部正預告修正此一適用標準，財政部祭出了四道緊箍咒，堵住財團法人租稅漏洞。

第一道：財團法人不得購買主要捐贈人及其關係企業發行的股票及公司債。換句話說，就是禁止回購捐贈事業股票，以免淪為控股單位。張芷說，「這是避免財團法人變成自家公司的控制股東」。

例如台塑捐贈長庚醫院，以後長庚醫院就不能再新增投資台塑股票，否則就不能享有免稅優惠。官員表示，這項措施不溯及既往，以新增為限。

張芷分析，因不溯及既往，對原有控股關係影響不大，但將會限制未來增加持股空間，也可以防止財團法人變相形成巨大控股公司。

第二道：提高財團法人免稅門檻，按機關或團體年度收入規模，分三級訂定支出比率。主要是提高大型財團法人公益支出比率。

將與創設目的相關支出占收入比重的門檻，由現行一律60％，改為年收1億元以上者，占比須達80％，年收5,000萬至1億元者，占比須達70％，其餘則維持現制。

張芷表示，將衝擊大型財團法人，尤其對每年股票孳息上億的財團法人影響更鉅，以一年獲配股利5億元的財團法人為例，與創設目的相符的公益支出必須達4億元才可以免稅。

第三道：將董監對象關係人納入規範，避免機關或團體受捐贈事業操控。財團法人的主要捐贈人如為營利事業，該捐贈事業與其關係人擔任財團法人董（理）監事的人數，不超過全體董（理）監事人數三分之一。

張芷認為，此一影響也不小，主要因現行大型財團法人，多為上市集團公司的控股公司或大股東，家族企業會擔憂醫療財團法人「大權旁落」，甚而影響對上市集團公司的控制力。

第四道：機關或團體不得以顯不相當的代價給予捐贈人或其關係人利益。

官員解釋，主要是避免機關或團體與捐贈人或其關係人間，藉由關係人交易以顯不相當代價給予關係人利益。