內政部二○○八年開辦地籍清理，八年來解決將近一半土地問題。地政司副司長施明賜表示，地方政府這些年清出許多有趣地籍案件，包括所有人登記為「土地公」、「聖母」等神祇，或標明「三角林埤」等農業功能。地籍清理可謂見證台灣日治時期至今各地宗教、農業文化。

施明賜說，台灣光復初期辦理土地登記，民眾對地制、土地所有權概念都並不健全，公務人員也不一定有完整法制概念；直到現在清理全台土地的所有權資料，「聖母」、「土地公」、「媽祖婆」等神祇竟也成為土地所有權人，還有標註農用功能的「三角林埤」，或者不知所云的「夜警會」、「眾田甲」，這些都與現行法令不符，須納入地籍清理範圍。

舉例來說，台北市有一塊土地登記為保生大帝所有，土地上是產權不明的低矮房屋；在地籍清理條例上路後，完成地籍清理登記，現在即將進行都市更新，土地現值高達一億七千九百多萬元。

日治時期日方強行徵收台人土地，施明賜指出，也有些人擔心宗廟土地被沒收，就登記在和尚、尼姑個人的名下，轉為私人土地就不怕日本人收走；光復後這些土地出現產權糾紛，因此地籍清理條例也專設第六章「寺廟或宗教團體土地之清理」，來規範這些土地問題。

據內政部統計，全台總共有十五萬兩千多筆土地地籍不完整、與現行法令規定不符。施明賜指出，這些土地中包括神明會、日治時期會社或組合土地、名字住址資料不全、所有權人非自然人或法人。這四大類總計五萬八千九百八十四筆，逾期沒人申報或申請登記，都會直接代為標售。