財政部指出，已申請由總機構總繳營業稅款的營利事業，其分支機構發生增減等變更事項時，應由分支機構所在地稽徵機關辦理異動通報。

經財政部核准由總機構總繳營業稅款的營業人，如發生分支機構新增、註銷或變更事項時，應由分支機構所在地的稽徵機關，依其申請事項辦理異動，免再由營業人的總機構提出申請。

財政部提醒，經核准總繳的營業人，其總機構在申報營業稅時，未依營業稅法規定期限向主管稽徵機關分別申報「各單位分別申報」及「總機構彙總申報」銷售額稅額申報書，會受到處罰。

包括，其僅申報其中一份申報書者，應就該逾期未申報部分，依加值型及非加值型營業稅法第49條規定處罰；如二份申報書均逾期申報者，應依同法第49條規定，擇一從重處罰。