房地合一制施行前，出售房產一律按舊制房、地分開課稅，其中，土地免課所得稅，能夠提示或經稅捐機關查獲有實價買賣價格者，售屋所得均需優先按實價報稅。財政部北區國稅局指出，售屋課稅案件已為五區國稅局的必查案件，未按實價報稅者，均會被列入調查。

配合查稅作業，國稅局亦訂有輔導機制，納稅人在申報財產交易所得後，如未主動提示成本或售價等實價資料，經國稅局訪查包括銀行或交易前、後手舉證的買賣價格後，即會輔導納稅人按實價報稅，拒按國稅局查核資料申報者，才會開罰。

北區國稅局查獲一宗案例，納稅人甲辦理102年度綜合所得稅結算申報時，自行以房屋契稅繳款書上記載的移轉價格580萬元，按評定現值28%，列報財產交易所得162.4萬元。

國稅局經查其實際交易價格資料後發現，甲取得房屋的實際成本是1,480萬元，實際售價為2,100萬元，扣除仲介及代書費等相關費用79.5萬元後，核定甲應申報房屋的財產交易所得為540.5萬元，國稅局輔導甲補稅，但甲未在期限內補報結果遭到處罰。

甲主張自己沒有單據，無法提供相關資料，強調並非故意拒絕補稅。

國稅局基於綜所稅係採自動申報制，不能以未保留相關資料或不知法令而免除應盡的注意義務，駁回其復查申請。

北區國稅局強調，房地合一實價課稅新制明（2016）年才要實施，在此之前，出售房屋的財產交易所得，只要經稽徵機關查獲實際交易資料，就要按實價報稅。

國稅局提醒，所得稅法施行細則第17條之2第1項規定，僅是稽徵機關在納稅人未申報或未能提出證明文件時，可以改按財政部頒訂標準核定財產交易所得的依據，並非賦予納稅人藉由不提供實價資料，達到減少稅負目的的工具。